2022/12/19更新：この現象はv4.1.31で修正されました。
対象
・Xrossモードのメインシート
現象
下記2つ条件を満たす場合に、ピボットテーブルの列見出しによるフィルタを指定した際に、列見出しが非表示となります。
＜発生条件＞
・フィルタによる絞り込みで、表示対象レコードが0件となる
・総計を非表示にしている。または、値フィールドの設定で「行と列の集計を行わない」を選択している
回避方法
総計を表示した上で、値フィールドの設定で「行と列の集計を行う」を選択することで現象を回避可能です。
今後のアップデートで改善される予定です。