2021/1/28更新：この現象はv5.1.15で修正されました。
現象
自動採番で出力する番号がすべて数値だけで構成されている場合、krewDataのフローを２回目以降に実行した時に、採番される自動採番が正しく行われません。
これは、2回目以降に実行した際に、すでに採番済みの番号を正しく検出することができないために発生しています。このため、出力アプリコマンドを「追加」や「更新」に設定し、すでに採番済みの番号から自動採番する場合にのみ発生します（すでに採番済みの番号を使用しない「再生成」でフローを実行した場合は、正しく自動採番されます）。
回避方法
この現象に対する回避方法はありません。
今後のアップデートで改善される予定です。